Ilmanpäästöt
Helsingin satamien ympäristöluvat velvoittavat osallistumaan pääkaupunkiseudun ilmanlaadun yhteistarkkailuun.

Hernesaaressa, Länsisataman läheisyydessä on Helsingin seudun ympäristöpalvelujen (HSY) ilmanlaadun mittausasema. Mittauksilla tarkkaillaan pääasiassa laivojen, autoliikenteen ja työkoneiden päästöjä, energiantuotantoa sekä kaukokulkeumaa.
HSY raportoi, että vuonna 2010, kun mitauspiste oli Eteläsatamssa, typpidioksidin raja- ja ohjearvot eivät ylittyneet. Typpidioksidin vuosiraja-arvo on 40 μg/m3. Myöskään pienhiukkasten raja-arvo ei ylittynyt, mutta WHO:n määrittelemä vuorokauden ohjearvo ylittyi yleensä muutamina päivinä vuodessa koko pääkaupunkiseudulla pääosin kaukokulkeuman vuoksi. Mittausasemia on pääkaupunkiseudulla yhteensä 11 ja tulokset päivittyvät tunneittan HSY:n verkkosivuille.
►Helsingin Sataman vuosikertomus 2010
Lisätietoja mittausasemista ja ilmanlaadun tarkkailusta Helsingissä:
► HSY ilmanlaatu
► HSY:n vuosiraportti 2010
Pakokaasupäästöt
Satamatoiminnan ja alusliikenteen keskeisimpiä ilmapäästöjä ovat typpioksidit (NOx), hiilidioksidi (CO2) ja rikkidioksidi (SO2) sekä hiukkaspäästöt kuten noki. 
Erityisesti rikkidioksidipäästöt ovat tyypillisiä laivaliikenteelle, sillä tieliikenteen polttoaineet ovat nykyään rikittömiä. Laivojen rikkidioksidipäästöt riippuvat käytettyjen polttoaineiden rikkipitoisuuksista sekä liikenteen määrästä.
Helsinkiin säännöllisesti liikennöivien matkustaja-alusten polttoaineiden rikkipitoisuus on tällä hetkellä 0,1 -1,0 %. Marpol 73/78 – yleissopimuksen ilmansuojeluliitteen voimaan astuminen ja sitä kautta rikkipitoisuusrajojen tiukkeneminen vaikuttaa lähinnä kansainvälisten risteilyalusten ja rahtialusten päästöihin.
Lisätietoja: Liikenteen turvallisuusvirasto (Trafi)